重慶交通大學學報分為自然科學版和社會科學版。《重慶交通大學學報(自然科學版)》創刊于1982年，原名《重慶交通學院學報》，是由原交通部主管、原重慶交通學院主辦，面向國內外公開發行的學術性刊物，2007年更名為《重慶交通大學學報(自然科學版)》重慶交通大學學報:自然科學版 2016年 第S1期目錄：

　　沙漠“土壤化”生態恢復理論與實踐易志堅 (27)

　　三峽新通道研究進展及主要技術問題張緒進;吳澎;王召兵;馬希欽 (33)

　　三峽水庫航道泥沙淤積模式及航道通過能力提升研究楊勝發;李文杰;胡小慶;胡江;王濤 (41)

　　瀝青混合料內的水氣運動羅蓉;黃婷婷 (49)

　　大型橋梁安全監測評估新技術探索與實踐周建庭;藍章禮;梁宗保 (61)

　　西藏交通“十三五”發展規劃與科技人才需求次仁拉姆;次德吉;衛強 (72)

　　黔滇公路二十四道拐的修筑及其歷史價值研究張勃;萬宇;劉玚;鄒人倜 (79)

　　世界屋脊筑天路,重慶交大奠基人——緬懷川藏公路政委穰明德尚婷;唐伯明