2024年8月18日，哈爾濱工業(yè)大學(xué)蔣慶華，哈爾濱醫(yī)科大學(xué)季勇、許召春共同通訊在Nature Communications 在線發(fā)表題為“Deciphering cell–cell communication at single-cell resolution for spatial transcriptomics with subgraph-based graph attention network”的研究論文，該研究提出了一種名為DeepTalk的通用方法，通過(guò)整合單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)數(shù)據(jù)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(ST)數(shù)據(jù)，以單細(xì)胞分辨率推斷空間CCC。

　　細(xì)胞間通訊(CCC)的推斷對(duì)于更好地理解生物系統(tǒng)中復(fù)雜的細(xì)胞動(dòng)力學(xué)和調(diào)節(jié)機(jī)制至關(guān)重要。然而，在單細(xì)胞分辨率下準(zhǔn)確推斷空間CCCs仍然是一個(gè)重大挑戰(zhàn)。DeepTalk利用圖關(guān)注網(wǎng)絡(luò)(GAT)集成scRNA-seq和ST數(shù)據(jù)，從而能夠?qū)�單�?xì)胞ST數(shù)據(jù)進(jìn)行準(zhǔn)確的細(xì)胞類型識(shí)別，并對(duì)基于點(diǎn)的ST數(shù)據(jù)進(jìn)行反卷積。然后，DeepTalk可以利用基于子圖的GAT捕獲多層次細(xì)胞之間的連接，進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞分辨率的空間分辨CCC推理。DeepTalk在多個(gè)跨平臺(tái)數(shù)據(jù)集上發(fā)現(xiàn)有意義的空間CCCs方面取得了優(yōu)異的成績(jī)，這證明了其在復(fù)雜生物過(guò)程中剖析細(xì)胞行為的卓越能力。

　　Nature子刊陣容壯大，而在璀璨的星空中，Nature Communications(NC)以其獨(dú)特的身份脫穎而出。作為Nature打頭的綜合性期刊，NC雖同屬子刊序列，卻展現(xiàn)出別樣的風(fēng)采。以其廣泛的接受領(lǐng)域、龐大的發(fā)文量，以及對(duì)高質(zhì)量研究的開(kāi)放態(tài)度，成為了眾多科研工作者展示成果的重要平臺(tái)。

　　Nature子刊，即Nature Research Journals，是科研細(xì)分領(lǐng)域的璀璨星辰，每一本都專注于某一特定研究方向，以深度與廣度并重的內(nèi)容，成為各自領(lǐng)域內(nèi)不可或缺的權(quán)威之聲。這些子刊不僅數(shù)量眾多，且質(zhì)量上乘，多數(shù)擁有較高的影響因子，代表著所在領(lǐng)域的科研前沿與頂尖水平。

　　Nature旗下期刊(共200種)，根據(jù)學(xué)術(shù)界的認(rèn)可度與影響力，可大致劃分為5大類別：

　　01正刊：作為Nature系列期刊的領(lǐng)頭羊，《Nature》正刊以其無(wú)與倫比的權(quán)威性和影響力，穩(wěn)居科研殿堂的頂端。

　　02Nature打頭的研究系列子刊與Review系列子刊：這兩大系列共計(jì)69本子刊，覆蓋了生命科學(xué)、物理科學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)和社會(huì)科學(xué)等多個(gè)領(lǐng)域，以深度分析和前沿研究著稱，是各自領(lǐng)域的權(quán)威期刊。

　　03Nature Communications(NC)：作為Nature打頭的特殊子刊，NC以其綜合性、開(kāi)放性和龐大的發(fā)文量，成為連接科研人員與科研成果的重要橋梁。

　　04Nature 合作創(chuàng)辦的刊物：Nature出版集團(tuán)與其他單位攜手合作，推出了128種高質(zhì)量期刊，這些刊物在學(xué)術(shù)水平上不亞于子刊，為科研人員提供了更多元化的發(fā)表選擇。

　　05Scientific Reports：作為Nature Portfolio旗下的一本多學(xué)科開(kāi)放獲取期刊，Scientific Reports以其廣泛的接受領(lǐng)域和快速的同行評(píng)審流程，為科研人員提供了一個(gè)展示初步研究成果的優(yōu)質(zhì)平臺(tái)。盡管有時(shí)被部分學(xué)者視為“水刊”，但其開(kāi)放性和高效性無(wú)疑為科研界帶來(lái)了更多的活力和多樣性。

　　無(wú)論是以第一作者，通訊作者，還是第一單位在nature期刊發(fā)表論文，都可以帶來(lái)極大的榮譽(yù)，而且Nature始終以其卓越的品質(zhì)和廣泛的影響力，引領(lǐng)著全球科研的潮流與方向。

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