摘要:系統(tǒng)論述了蛋白質(zhì)乙酰化修飾的類型、作用、研究現(xiàn)狀及未來發(fā)展趨勢。尤其是介紹了絲氨酸和蘇氨酸乙酰化修飾的重要作用,為研究乙酰化修飾開拓了新的思路。
摘要:系統(tǒng)論述了蛋白質(zhì)乙酰化修飾的類型、作用、研究現(xiàn)狀及未來發(fā)展趨勢。尤其是介紹了絲氨酸和蘇氨酸乙酰化修飾的重要作用,為研究乙酰化修飾開拓了新的思路。
關(guān)鍵詞:賴氨酸絲氨酸蘇氨酸乙酰化修飾
蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的活性、定位或功能,蛋白質(zhì)最初發(fā)生的翻譯后修飾直接或間接地與其他翻譯后修飾通過協(xié)同機(jī)制或競爭機(jī)制來完成其作用。這些翻譯后修飾增加了細(xì)胞通路機(jī)制的多樣性和復(fù)雜性[1]。氨基酸的乙酰化修飾是一種可逆的在真核細(xì)胞和原核細(xì)胞中都能表達(dá)的翻譯后修飾過程,在過去的幾十年中,科學(xué)家對氨基酸的乙酰化修飾進(jìn)行了很多研究。
1.蛋白質(zhì)乙酰化修飾的重要作用
蛋白質(zhì)中的賴氨酸乙酰化修飾調(diào)控蛋白質(zhì)的多種性質(zhì),包括DNA-蛋白質(zhì)相互作用、亞細(xì)胞定位、轉(zhuǎn)錄活性、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等等[2,3]。除了這些重要的生物學(xué)功能外,賴氨酸乙酰化蛋白質(zhì)及其調(diào)控酶與衰老和幾種重大疾病(如癌癥、神經(jīng)變形紊亂、心血管疾病等)緊密相聯(lián)[2-6]。因此,在過去的幾十年中,人們對賴氨酸乙酰化修飾進(jìn)行了大量的研究,取得了豐碩成果。
除了賴氨酸可以發(fā)生乙酰化修飾外,其他氨基酸是否可以發(fā)生乙酰化修飾?其他氨基酸的乙酰化修飾具有哪些重要的生物學(xué)功能?最近,KimOrth及其同事在研究耶爾森菌屬的效應(yīng)因子YopJ(一個細(xì)菌毒力因子)時,發(fā)現(xiàn)在真核生物中存在著一種重要的翻譯后修飾形式:絲氨酸和蘇氨酸的乙酰化修飾[7]。絲氨酸和蘇氨酸的磷酸化和O-糖基化修飾可以導(dǎo)致細(xì)胞信號傳導(dǎo)機(jī)制的重大改變[8],KimOrth及其同事發(fā)現(xiàn)在YopJ中,絲氨酸和蘇氨酸的乙酰化修飾與這些氨基酸的磷酸化修飾相互競爭,從而改變細(xì)胞的信號通路機(jī)制[9]。這些發(fā)現(xiàn)給我們一個啟示:賴氨酸、絲氨酸、蘇氨酸等氨基酸的乙酰化修飾可以與甲基化、泛素化、磷酸化、糖基化等翻譯后修飾相互競爭,從而影響細(xì)胞信號通路機(jī)制[10]。
2.鑒定乙酰化修飾的技術(shù)探討
隨著在絲氨酸和蘇氨酸上發(fā)現(xiàn)了新的乙酰化修飾并且這些修飾具有重要的生物學(xué)功能,對除賴氨酸之外的其他氨基酸的乙酰化修飾應(yīng)予以重視。目前用于鑒定乙酰化修飾的方法主要有以下幾種:
2.1通過生物質(zhì)譜鑒定乙酰化修飾位點(diǎn)
由于質(zhì)譜提供了結(jié)構(gòu)變化方面的直接證據(jù),所以它是用于鑒定蛋白質(zhì)修飾的最好的技術(shù)。質(zhì)譜技術(shù)通過檢測到的肽段的質(zhì)量與預(yù)測的肽段的質(zhì)量進(jìn)行對比,如果二者質(zhì)量相差42amu,則認(rèn)為在氨基酸殘基或在蛋白質(zhì)末端發(fā)生乙酰化修飾。通過從鑒定到的肽段的N末端或C末端逐個分析得到的b離子或y離子,就可以確定發(fā)生乙酰化修飾的氨基酸位點(diǎn)。
2.2基于特異性識別乙酰化賴氨酸殘基的乙酰化抗體
對于賴氨酸的乙酰化修飾,Kim及其同事用免疫親和純化技術(shù)富集賴氨酸乙酰化修飾的肽段,在Hela細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和線粒體中發(fā)現(xiàn)了195種賴氨酸乙酰化修飾蛋白[2]。但是,賴氨酸乙酰化抗體只能特異性識別賴氨酸殘基發(fā)生修飾的蛋白質(zhì)或肽段,不能檢測到絲氨酸和蘇氨酸的乙酰化修飾。用特異性識別絲氨酸或蘇氨酸乙酰化修飾的抗體將大大有利于絲氨酸和蘇氨酸乙酰化修飾的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。
2.3以標(biāo)記底物為基礎(chǔ)的方法
Yu及其同事在酶GNAT的作用下,用氯代乙酰化CoA與其作用底物L(fēng)12反應(yīng),導(dǎo)致氯代乙酰化L12的生成。然后將氯代乙酰化L12與熒光素His18俘獲的肽段一起孵育,經(jīng)過氯消除后,純化后的標(biāo)記的底物通過熒光自顯影便可看到。在將來的研究中,用其他方法衍生的乙酰化CoA對于研究乙酰化后修飾會有很大幫助,因?yàn)榈孜锟梢酝ㄟ^親和標(biāo)記物乙酰化CoA進(jìn)行標(biāo)記,經(jīng)過分離后,在分子水平上對賴氨酸、絲氨酸、蘇氨酸或其他氨基酸的乙酰化修飾進(jìn)行分析。
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